(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202211009665.X (22)申请日 2022.08.22 (71)申请人 西安交通大 学 地址 710049 陕西省西安市碑林区咸宁西 路28号 (72)发明人 张杰　司茹　潘晓艳　卢闻　 单媛媛　王瑾　 (74)专利代理 机构 西安通大专利代理有限责任 公司 6120 0 专利代理师 安彦彦 (51)Int.Cl. C07K 5/062(2006.01) A61K 38/05(2006.01) A61P 35/00(2006.01) (54)发明名称 一种基于生物正交反应的细胞内自组装降 解剂及其制备方法和应用 (57)摘要 本发明公开一种基于生物正交反应的细胞 内自组装降解剂及其制备方法和应用， 通过使用 链接体将靶蛋白配体Linifanib或S5和生物正交 基团降冰片烯连接， 获得带有降冰片烯基团的靶 蛋白配体； 通过连接链将四嗪基团修饰在E3泛素 连接酶配体上， 得到带有四嗪的E3泛素连接酶配 体； 通过分步给药的方法， 使带有降冰片烯基团 的靶蛋白配体分子和带有四嗪的E3泛素连接酶 配体先后进入细胞， 在细胞内发生生物正交反应 自组装， 形成蛋白降解剂。 本发明构建的细胞内 自组装蛋白降解剂 的制备方法简单， 易于实现， 并且收率较高， 能够用于制备治疗癌症的药物 中， 尤其用于制备以PDGFR ‑β为靶点的抗肿瘤药 物中。 权利要求书2页 说明书12页 附图2页 CN 115286687 A 2022.11.04 CN 115286687 A 1.一种基于生物正交反应的细胞内自组装降解剂， 其特征在于， 该降解剂的结构式如 下： 其中X＝1～6， Y＝2 ～10， R1＝CH3或Cl， R2＝F或H， R3＝CH3或H， R4＝Ph或CH2。 2.一种如权利要求1所述的基于生物正交反应的细胞内自组装降解剂的制备方法， 其 特征在于， 包括以下步骤： 通过使用链接体将靶蛋白配体Linifanib和降冰片烯连接， 或通过使用链接体将靶蛋 白配体S5和降冰片烯连接， 获得带有降冰片烯基团的靶蛋白配体； 其中， 靶蛋白配体S 5结构 式如下： 通过连接链将四嗪基团修饰在E3泛素连接酶配体上， 得到带有四嗪的E3泛素连接酶配 体； 使带有降冰片烯基团的靶蛋白配体分子和带有四嗪的E3泛素连接酶配体先后进入细 胞， 在细胞内发生 生物正交反应自组装， 形成基于生物正交反应的细胞内自组装降解剂。 3.根据权利要求2所述的基于生物正交反应的细胞内自组装降解剂的制备方法， 其特 征在于， 所述带有降冰片烯基团的靶蛋白配 体的结构式如下：权　利　要　求　书 1/2 页 2 CN 115286687 A 2其中， X＝1～6， R1＝CH3或Cl， R2＝F或H。 4.根据权利要求2或3所述的基于生物正交反应的细胞内自组装降解剂的制备方法， 其 特征在于， 所述带有降冰片烯基团的靶蛋白配 体通过以下 过程制得： 将靶蛋白配体Linifanib或靶蛋白配体S5与链接体经酰胺缩合反应， 得到带有Boc保护 基化合物， 然后经氯化氢的乙酸乙酯作用脱除Boc保护基， 再与5 ‑降冰片烯 ‑2‑羧酸经酰胺 缩合反应， 得到带有降冰片烯基团的靶蛋白配 体。 5.根据权利要求2所述的基于生物正交反应的细胞内自组装降解剂的制备方法， 其特 征在于， 所述带有四嗪 的E3泛素连接酶配 体的结构式如下： 其中， Y＝2 ～10， R3＝CH3或H， R4＝Ph或CH2。 6.根据权利要求2或5所述的基于生物正交反应的细胞内自组装降解剂的制备方法， 其 特征在于， 所述带有四嗪 的E3泛素连接酶配 体通过以下 过程制得： 将乙腈、 氰基化合物以及水合肼在三氟甲磺酸锌或三氟甲磺酸镍的作用下， 或者将醋 酸甲脒、 氰基化合物以及水合肼在三氟甲磺酸锌的作用下， 经环 化反应， 氧化脱 氢形成1,2, 4,5‑四嗪类化合物， 然后在三氟乙酸的作用下脱去Boc 保护基， 再通过二酸与E3泛 素连接酶 配体VH032连接， 形成带有四嗪 的E3泛素连接酶配 体。 7.根据权利要求2所述的基于生物正交反应的细胞内自组装降解剂的制备方法， 其特 征在于， 所述蛋白降解剂具体通过以下 过程制得： 将带有降冰片烯基团的靶蛋白配体溶液加入到含有细胞的培养皿中孵育， 再加入带有 四嗪的E3泛素连接酶配 体， 孵育， 在细胞内经自组装形成蛋白降解剂。 8.一种如权利要求1所述的基于生物正交反应的细胞内自组装降解剂在制备抗肿瘤药 物中的应用。 9.根据权利要求8所述的应用， 其特征在于， 抗肿瘤药物为能够选择性诱导PDGFR ‑β 蛋 白的降解的药物。 10.根据权利要求8所述的应用， 其特 征在于， 抗肿瘤药物为 抗神经胶质瘤药物。权　利　要　求　书 2/2 页 3 CN 115286687 A 3