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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210906372.5 (22)申请日 2022.07.29 (71)申请人 张弩 地址 510080 广东省广州市中山 二路58号 中山大学附属第一医院 院长办公室 (72)发明人 张弩 闫超 姚宏伟  (74)专利代理 机构 北京智丞瀚方知识产权代理 有限公司 1 1810 专利代理师 姜司晨 (51)Int.Cl. C07K 14/82(2006.01) C12N 15/12(2006.01) G01N 33/574(2006.01) G01N 33/68(2006.01) C12N 15/113(2010.01)C12N 9/22(2006.01) C12N 15/85(2006.01) C12Q 1/6886(2018.01) A61K 45/00(2006.01) A61P 35/00(2006.01) (54)发明名称 一种蛋白及其应用 (57)摘要 本申请提供一种蛋白, 所述蛋白由SEQ  ID  No: 1所示的氨 基酸序列组成, 或是在SEQ  ID No: 1所示的氨基酸序列中添加、 替换或缺失1 ‑n个氨 基酸形成具有相同功能的蛋白, n为正整数; 或在 SEQID No: 1所示的蛋白的N端和/或C端连接标签 得到的融合蛋白; 或与SEQ  ID No: 1所示的氨基 酸序列具有75%以上同源性且具有相同功能的 蛋白; 并提供了其应用。 本申请提供的蛋白能够 用于胰腺癌、 结肠癌、 肺癌、 胃癌、 胆管癌、 子宫内 膜癌、 睾丸生殖细胞癌、 宫颈癌、 皮肤癌、 多发性 骨髓瘤、 胶质瘤等恶性肿瘤的诊断或治疗, 尤其 是当这些恶 性肿瘤出现了 KRAS突变的情况, 该蛋 白的作用将更加显著。 权利要求书2页 说明书17页 附图12页 CN 115215935 A 2022.10.21 CN 115215935 A 1.一种蛋白, 其特 征在于, 所述蛋白由SEQ  ID No: 1所示的氨基酸序列组成; 或是在SEQ  ID No: 1所示的氨基酸序列中添加、 替换或缺失1 ‑n个氨基酸形成具有相同 功能的蛋白, n 为正整数; 或在SEQ ID No: 1所示的蛋白的N端和/或C端连接标签得到的融合蛋白; 或是与SEQ  ID No: 1所示的氨基酸序列具有75%以上同源性且具有相同功能的蛋白。 2.一种编码权利要求1中所述蛋白的基因, 其特 征在于, 所述基因由SEQ  ID No: 2所示的核苷酸序列组成; 或是在SEQ  ID No: 2所示的核苷酸序列组成中添加、 替换或缺失1 ‑n个碱基生成的核苷 酸序列, n 为正整数; 或是与SEQ  ID No: 2所示的核苷酸序列具有75%以上同源性且具有相同功能的基因。 3.如下任一所述的产品在制备用于诊断或治疗与KRAS基因突变相关疾病的产品中的 应用; 1)用于检测或抑制权利要求1所述蛋白的表达的产品; 2)用于使权利要求1所述蛋白失活的产品; 3)用于检测或干扰权利要求2所述基因的转录和翻译的产品; 4)用于使权利要求2所述基因失活的产品。 4.根据权利要求3所述的应用, 其特 征在于, 所述产品包括: 能够检测权利要求1所述蛋白表达的抗体、 能够去除权利要求2所述基因 的基因编辑试 剂盒、 能够去除权利要求2所述基因中编码权利要求1所述蛋白的ORF的全部序列或部分序 列或使其产生移码突变序列的基因编辑试剂盒、 能够减少或去除权利要求2所述基因转录 的RNA的siRNA或shRNA、 能够减少或去除权利要求2所述基因转录的RNA中编码所述蛋白ORF 序列的siRNA或shRNA、 能够结合权利要求2所述基因转录的RNA的RNA抑制剂、 能够结合权利 要求2所述基因转录的RNA的RNA降解剂、 能够抑制权利要求1所述蛋白功能的蛋白抑制剂、 能够抑制权利要求1所述蛋白与RAS结合的蛋白抑制剂、 能够降解权利要求1所述蛋白的蛋 白降解剂。 5.根据权利要求 4所述的应用, 其特 征在于, 所述siRNA的核苷酸序列如序列表中SEQ  ID No: 4‑SEQ ID No: 15的任意 一种所示; 所述shRNA表达质粒基于序列表中SEQ  ID No: 4‑SEQ ID No: 15的任意一种所示的序列 构建, 构建过程为: 通过启动子启动shRNA的表达, 并将shRNA表达序列构建至表达载体中得 到; 所述gRNA的靶序列如序列表中SEQ  ID No: 16‑SEQ ID No: 90的任意 一种所示。 6.如下任一所述的方法在制备用于诊断或治疗与KRAS基因突变相关疾病的产品中的 应用; 1)用于检测或抑制权利要求1所述蛋白的表达的方法; 2)使权利要求1所述蛋白失活的方法; 3)用于检测或干扰权利要求2所述基因的转录和翻译的方法; 4)使权利要求2所述基因失活的方法。 7.根据权利要求6所述的应用, 其特 征在于, 所述方法包括:权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 115215935 A 2能够检测权利要求1所述蛋白表达的抗体检测方法、 能够检测权利要求2所述基因转录 的PCR方法、 能够 去除权利要求2所述基因的基因编辑方法、 能够去除权利要求2所述基因中 编码权利要求1所述蛋白的ORF的全部序列或部分序列或使其产生移码突变序列的基因编 辑方法、 能够减少或去除权利要求2所述基因转录的RNA的RNAi方法、 能够减少或去除权利 要求2所述基因转录的RNA中编码 权利要求1所述蛋白的ORF序列的RNAi方法、 能够抑制权利 要求2所述基因转录的RNA的抑制方法、 能够降解权利要求2所述基因转录的RN  A的降解方 法、 能够抑制权利要求1所述蛋白或抑制权利要求 1所述蛋白与RAS结合的抑制方法、 能够降 解权利要求1所述蛋白的降解方法。 8.根据权利要求7 所述的应用, 其特 征在于, 所述RNAi方法中, 采用核苷酸序列如序列表中SEQ  ID No: 4‑SEQ ID No: 15的任意一种 所示的siRNA; 或采用基于序列表中SEQ  ID No: 4‑SEQ ID No: 15的任意一种所示的序列构建的shRNA 表达质粒, 构建过程为: 通过启动子启动shRNA的表达, 并将shRNA表达序列构建至表达载体 中得到的所述shRNA 表达质粒; 所述RNA编辑方法中, 采用靶序列如序列表中SEQ  ID No: 16‑SEQ ID No: 90的任意一种 所示的gRNA, 使蛋白失活。 9.如权利要求3 ‑5或6‑8所述的应用, 其特征在于, 所述基因编辑试剂盒为CRISPR/Cas9 基因编辑试剂盒, 所述基因编辑方法为CRI  SPR/Cas9基因编辑方法。 10.如权利要求9所述的应用, 其特征在于, 所述与KRAS基因突变相关的疾病为恶性肿 瘤。 11.如权利要求10所述的应用, 其特征在于, 所述与KRAS基因突变相关的恶性肿瘤包括 但不限于: 胰腺癌、 结肠癌、 肺癌、 胃癌、 胆管癌、 子 宫内膜癌、 睾丸生殖细胞癌、 宫颈癌、 皮肤 癌、 多发性骨髓瘤和胶质瘤。 12.如权利要求11所述的应用, 其特征在于, 所述KRAS基因突变为: KRASG12A、 G12C、 G12D、 G12F、 G12R、 G12S、 G12V、 G12Y、 G13C、 G13D、 G15C、 Q22K、 S39Y、 A59T、 G60D、 Q61H、 Q61L、 Q61R、 Y64H、 A146T、 A146V突变中的至少一种。 13.如权利要求12所述的应用, 其特征在于, 所述产品中还包含有可联合使用的其他 能 够用于诊断或治疗与KRAS基因突变相关疾病的药物、 制剂、 方法。 14.如权利要求13所述的应用, 其特征在于, 所述可联合使用的药物或制 剂为针对KRAS 基因突变的靶向小分子抑制剂或针对癌症的靶向小分子药物。 15.如权利要求14所述的应用, 其特征在于, 所述针对KRAS基因突变的靶向小分子抑制 剂为AMG 510、 MRTX849、 RMC ‑4630、 BI 1701963、 MRTX1133; 所述针对癌症的靶向小分子 药物 为EGFR小分子靶向药物、 抗EGFR单克隆抗体药物、 泛 ‑ERBB抑制剂或RAS信号通路相关抑制 剂; 所述RAS信号 通路相关抑制剂为靶向FGFR、 RAF、 M EK、 ERK、 PI3K、 AKT、 RAL的抑制剂。 16.如权利要求13所述的应用, 其特征在于, 所述可联合使用的方法为阻断肿瘤逃逸机 制的方法。 17.如权利要求16所述的应用, 其特征在于, 所述阻断肿瘤逃逸机制的方法中, 用于阻 断肿瘤逃逸机制的抑制剂为泛 ‑ERBB抑制剂或RAS信号通路相关抑制剂; 所述RAS信号通路 相关抑制剂为靶向FGFR、 RAF、 M EK、 ERK、 PI3K、 AKT、 RAL的抑制剂。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 115215935 A 3

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