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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202111384353.2 (22)申请日 2021.12.2 9 (71)申请人 深圳湾实验室坪 山生物医药研发转 化中心 地址 518118 广东省深圳市坪 山区坑梓街 道兰景路16号国富文化厂区 申请人 北京大学深圳研究生院 (72)发明人 李子刚 尹丰 张亚萍 姜乐盈 刘招弟 (74)专利代理 机构 上海政济知识产权代理事务 所(普通合伙) 31479 专利代理师 辇甲武 (51)Int.Cl. A61K 39/00(2006.01) A61K 39/385(2006.01)A61K 39/39(2006.01) A61K 47/54(2017.01) A61P 35/00(2006.01) (54)发明名称 基于DNA折纸的肿瘤新抗原递送系统及其制 备方法和应用 (57)摘要 本发明提供了一种基于DNA折纸的肿瘤新抗 原递送系统的制备方法, 选择8条单链DNA, 其中 三条单链的5 ’端延伸出20nt的ployT结构, 用于 与含有锍盐中心的肿瘤新抗原肽 ‑核酸可逆共价 偶联分子配对, 实现OVA抗原与DNA折纸的组装; 另外选择三条单链DNA, 在其5 ’端延伸出一段CpG 序列, 作为免疫激活辅助因子协同免疫系统激 活; 将上述用于制备DNA折纸的单链DNA和上述新 抗原肽‑核酸可逆共价偶联分子混合; 经过高温 变性, 退火杂交, 形成三角锥 状的DNA四面体纳米 复合物, 即为基于DNA折纸的肿瘤新抗原递送系 统。 实验证明本发明构建的含有锍盐中心的DNA 折纸递送系统显著抑制了肿瘤的生长和肿瘤细 胞的肺转移。 权利要求书2页 说明书9页 序列表3页 附图6页 CN 114588254 A 2022.06.07 CN 114588254 A 1.一种基于DNA折 纸的肿瘤新 抗原递送系统的制备 方法, 其特 征在于包括如下步骤: 1)一个设计用于制备DNA折纸的单链DNA的步骤, 在所述的设计用于制备DNA折纸的单 链DNA的步骤中, 设计8条 单链DNA; 第一条单链DNA的5 ’端至3’端的碱基含有两个功能 区; 第二条单链DNA的5 ’端至3’端的碱基含有三个功能 区; 第三条单链DNA的5 ’端至3’端的碱基含有两个功能 区; 第四条单链DNA的5 ’端至3’端的碱基含有两个功能 区; 第五条单链DNA的5 ’端至3’端的碱基含有三个功能 区; 第六条单链DNA的5 ’端至3’端的碱基含有两个功能 区; 第七条单链DNA的5 ’端至3’端的碱基含有两个功能 区; 第八条单链DNA的5 ’端至3’端的碱基含有两个功能 区; 所述的8条 单链DNA各功能 区碱基的配对情况如下: 第二条单链DNA的5 ’端至3’端的第二个功能区碱基与第五条单链DNA的5 ’端至3’端的 第一个功能 区、 第六条单链DNA的5 ’端至3’端的第二个功能 区碱基互补; 第三条单链DNA的5 ’端至3’端的第二个功能区碱基和第一条单链DNA的5 ’端至3’端的 第二个功能 区、 第二条 单链DNA的5 ’端至3’端的第一个功能 区碱基互补; 第四条单链DNA的5 ’端至3’端的第一个功能区碱基和第七条单链DNA的5 ’端至3’端的 第一个功能 区、 第八条 单链DNA的5 ’端至3’端的第二个功能 区碱基互补; 第五条单链DNA的5 ’端至3’端的第二个功能区碱基和第三条单链DNA的5 ’端至3’端的 第一个功能 区、 第四条 单链DNA的5 ’端至3’端的第二个功能 区碱基互补; 第七条单链DNA的5 ’端至3’端的第二个功能区碱基和第一条单链DNA的5 ’端至3’端的 第一个功能 区、 第二条 单链DNA的5 ’端至3’端的第三个功能 区碱基互补; 第八条单链DNA的5 ’端至3’端的第一个功能区碱基和第六条单链DNA的5 ’端至3’端的 第一个功能 区、 第五条 单链DNA的5 ’端至3’端的第三个功能 区碱基互补; 第二条、 第三条、 第七条单链DNA的5 ’端设置有一段CpG的序列, 所述的CpG的序列如SEQ ID NO.3所示; 第一条、 第五条和第六条单链DNA的5 ’端延伸出20nt的ployT结构, 用于与含 有锍盐中心的新 抗原肽‑核酸可逆 共价偶联分子互补配对, 2)将上述用于制备DNA折纸的第一到第八单链DNA与含有锍盐中心的肿瘤新抗原肽 ‑核 酸可逆共价偶联分子之间分别按照1:1 ‑1.2的摩尔比混合; 3)将步骤1)中的混合物经过高温变性, 退火杂交, 8条ssDNA自组装成三角锥状的DNA四 面体纳米复合物, 所述的DNA四面体每条边长的碱基数为 15‑30bp, 即为基于DNA折纸的肿瘤 新抗原递送系统。 2.根据权利要求1所述的一种基于DNA折纸的肿瘤新抗原递送系统的制备方法, 其特征 在于, 在该四面体结构的六条边上均有一个开口位置, 用于引入三条新抗原肽和三条免疫 佐剂, 保证其分别被固定在DNA折 纸的一条边上, 且朝向互不干扰。 3.根据权利要求1所述的一种基于DNA折纸的肿瘤新抗原递送系统的制备方法, 其特征 在于, 第一到第八单链DNA之间的摩尔比为1: 1: 1: 1: 1: 1: 1: 1。 4.根据权利要求1所述的一种基于DNA折纸的肿瘤新抗原递送系统的制备方法, 其特征 在于, 所述的含有锍盐中心的肿瘤新抗原肽 ‑核酸可逆共价偶联分子的制备方法包括如下权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 114588254 A 2步骤: 1)选择一个肿瘤新抗原肽, 在所述的肿瘤新抗原模拟肽的N端引入一个甲硫氨酸, 随后 在该甲硫氨酸 位置引入炔丙基锍盐; 2)选用一条20nt的ployA序列, 在ploy20A的5 ’端进行了C6巯基修饰, 然后 进行预处理, 使其打开因二硫键自聚形成的二聚物; 3)在(NH4)2CO3缓冲液中, 将步骤2)预处理的DNA和步骤1)中带有炔丙基锍盐中心的肿 瘤新抗原肽混合, 制备获得含有锍盐中心的新 抗原肽‑核酸可逆 共价偶联分子 。 5.根据权利要求4所述的一种基于DNA折纸的肿瘤新抗原递送系统的制备方法, 其特征 在于, 所述的肿瘤新抗原模拟肽为OVA 抗原肽, 所述的OVA 抗原肽是鸡卵清蛋白OVA的抗原表 位。 6.权利要求1所述的方法获得的基于DNA折 纸的肿瘤新 抗原递送系统。 7.一种疫苗, 含有权利要求5的方法获得的基于DNA折 纸的肿瘤新 抗原递送系统。 8.权利要求7 所述的疫苗在制备用于肿瘤免疫 治疗的药物中的用途。 9.权利要求7 所述的疫苗在制备用于肿瘤免疫预防的药物中的用途。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 114588254 A 3
专利 基于DNA折纸的肿瘤新抗原递送系统及其制备方法和应用
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